Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA1P01009 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINA1P01009 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINA1P01009 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINA1P01009 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA1P01009 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA1P01009 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA1P01009 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA1P01009 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA1P01009 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA1P01009 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA1P01009 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA1P01009 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA1P01009 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA1P01009 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA1P01009 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA1P01009 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA1P01009 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA1P01009 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA1P01009 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA1P01009 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA1P01009 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA1P01009 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA1P01009 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA1P01009 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms