Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX7O95931 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX7O95931 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX7O95931 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX7O95931 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX7O95931 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX7O95931 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX7O95931 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX7O95931 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX7O95931 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX7O95931 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX7O95931 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX7O95931 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX7O95931 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX7O95931 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX7O95931 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX7O95931 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms