Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP4K4O95819 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP4K4O95819 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms