Protein–RNA interactions for Protein: O95718

ESRRB, Steroid hormone receptor ERR2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRBO95718 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ESRRBO95718 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRBO95718 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRBO95718 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRBO95718 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRBO95718 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms