Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD4O95243 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD4O95243 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD4O95243 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD4O95243 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD4O95243 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD4O95243 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD4O95243 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD4O95243 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD4O95243 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD4O95243 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD4O95243 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD4O95243 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD4O95243 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD4O95243 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD4O95243 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD4O95243 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD4O95243 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD4O95243 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD4O95243 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD4O95243 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD4O95243 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD4O95243 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD4O95243 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD4O95243 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD4O95243 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD4O95243 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD4O95243 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD4O95243 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD4O95243 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD4O95243 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD4O95243 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD4O95243 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD4O95243 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD4O95243 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD4O95243 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD4O95243 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD4O95243 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD4O95243 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD4O95243 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD4O95243 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD4O95243 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD4O95243 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD4O95243 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD4O95243 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD4O95243 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD4O95243 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD4O95243 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD4O95243 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD4O95243 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD4O95243 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD4O95243 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD4O95243 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD4O95243 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD4O95243 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD4O95243 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD4O95243 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD4O95243 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD4O95243 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD4O95243 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD4O95243 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD4O95243 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms