Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31AO94979 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31AO94979 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms