Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG12O94817 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG12O94817 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG12O94817 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG12O94817 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG12O94817 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG12O94817 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG12O94817 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG12O94817 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG12O94817 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG12O94817 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG12O94817 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG12O94817 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms