Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIOO75962 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIOO75962 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIOO75962 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIOO75962 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIOO75962 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIOO75962 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIOO75962 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIOO75962 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIOO75962 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIOO75962 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIOO75962 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIOO75962 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIOO75962 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIOO75962 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOO75962 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOO75962 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOO75962 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOO75962 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOO75962 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOO75962 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOO75962 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIOO75962 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOO75962 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOO75962 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOO75962 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOO75962 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOO75962 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOO75962 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOO75962 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOO75962 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIOO75962 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOO75962 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOO75962 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOO75962 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOO75962 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOO75962 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOO75962 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIOO75962 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOO75962 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOO75962 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOO75962 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOO75962 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOO75962 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOO75962 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOO75962 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOO75962 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIOO75962 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOO75962 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOO75962 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOO75962 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIOO75962 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOO75962 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOO75962 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOO75962 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOO75962 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIOO75962 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOO75962 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOO75962 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOO75962 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOO75962 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOO75962 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOO75962 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOO75962 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIOO75962 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOO75962 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOO75962 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOO75962 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOO75962 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOO75962 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOO75962 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOO75962 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOO75962 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIOO75962 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIOO75962 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOO75962 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOO75962 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOO75962 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOO75962 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOO75962 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOO75962 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIOO75962 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOO75962 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOO75962 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOO75962 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOO75962 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOO75962 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOO75962 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms