Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASSF9O75901 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASSF9O75901 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASSF9O75901 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASSF9O75901 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASSF9O75901 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASSF9O75901 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASSF9O75901 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASSF9O75901 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms