Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms