Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SS18L1O75177 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SS18L1O75177 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SS18L1O75177 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SS18L1O75177 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SS18L1O75177 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SS18L1O75177 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SS18L1O75177 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SS18L1O75177 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SS18L1O75177 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms