Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms