Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBNO60934 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBNO60934 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBNO60934 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBNO60934 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBNO60934 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBNO60934 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBNO60934 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBNO60934 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBNO60934 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBNO60934 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NBNO60934 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBNO60934 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBNO60934 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBNO60934 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NBNO60934 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBNO60934 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBNO60934 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBNO60934 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBNO60934 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBNO60934 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBNO60934 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBNO60934 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBNO60934 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBNO60934 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBNO60934 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBNO60934 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBNO60934 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBNO60934 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBNO60934 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBNO60934 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBNO60934 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBNO60934 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NBNO60934 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBNO60934 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBNO60934 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBNO60934 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBNO60934 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBNO60934 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBNO60934 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBNO60934 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBNO60934 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NBNO60934 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBNO60934 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBNO60934 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBNO60934 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBNO60934 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBNO60934 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBNO60934 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBNO60934 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBNO60934 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBNO60934 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBNO60934 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBNO60934 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBNO60934 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBNO60934 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBNO60934 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBNO60934 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBNO60934 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBNO60934 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBNO60934 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBNO60934 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBNO60934 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBNO60934 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBNO60934 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBNO60934 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms