Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN3O60637 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN3O60637 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN3O60637 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms