Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KIAA0556O60303 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KIAA0556O60303 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms