Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms