Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3O43617 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms