Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ3O43525 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms