Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF4O43474 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF4O43474 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF4O43474 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF4O43474 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF4O43474 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF4O43474 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF4O43474 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF4O43474 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF4O43474 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF4O43474 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF4O43474 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF4O43474 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF4O43474 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF4O43474 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF4O43474 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF4O43474 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF4O43474 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF4O43474 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF4O43474 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF4O43474 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF4O43474 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF4O43474 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF4O43474 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF4O43474 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF4O43474 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF4O43474 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLF4O43474 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLF4O43474 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF4O43474 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF4O43474 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms