Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms