Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms