Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF5O14894 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms