Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME4O00746 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME4O00746 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NME4O00746 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME4O00746 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME4O00746 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME4O00746 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME4O00746 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME4O00746 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME4O00746 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME4O00746 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME4O00746 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME4O00746 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME4O00746 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME4O00746 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NME4O00746 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME4O00746 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME4O00746 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME4O00746 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME4O00746 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME4O00746 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME4O00746 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME4O00746 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME4O00746 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME4O00746 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME4O00746 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME4O00746 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME4O00746 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME4O00746 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME4O00746 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME4O00746 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME4O00746 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME4O00746 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME4O00746 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME4O00746 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME4O00746 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME4O00746 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME4O00746 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME4O00746 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME4O00746 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME4O00746 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME4O00746 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME4O00746 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME4O00746 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME4O00746 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME4O00746 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME4O00746 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME4O00746 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms