Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms