Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP1O00294 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP1O00294 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP1O00294 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP1O00294 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP1O00294 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP1O00294 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP1O00294 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP1O00294 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP1O00294 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TULP1O00294 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TULP1O00294 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP1O00294 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP1O00294 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP1O00294 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP1O00294 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP1O00294 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP1O00294 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP1O00294 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP1O00294 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP1O00294 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP1O00294 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP1O00294 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP1O00294 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP1O00294 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP1O00294 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP1O00294 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP1O00294 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP1O00294 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP1O00294 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP1O00294 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP1O00294 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP1O00294 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP1O00294 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP1O00294 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP1O00294 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP1O00294 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP1O00294 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP1O00294 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP1O00294 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP1O00294 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TULP1O00294 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP1O00294 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP1O00294 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP1O00294 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP1O00294 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP1O00294 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP1O00294 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP1O00294 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP1O00294 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms