Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFFAO00273 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DFFAO00273 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFFAO00273 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFFAO00273 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFFAO00273 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DFFAO00273 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DFFAO00273 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFFAO00273 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFFAO00273 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFFAO00273 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFFAO00273 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFFAO00273 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFFAO00273 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFFAO00273 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFFAO00273 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFFAO00273 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFFAO00273 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFFAO00273 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DFFAO00273 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFFAO00273 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFFAO00273 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFFAO00273 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFFAO00273 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFAO00273 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFFAO00273 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFFAO00273 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFFAO00273 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFFAO00273 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFFAO00273 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFFAO00273 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFFAO00273 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFFAO00273 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFFAO00273 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DFFAO00273 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DFFAO00273 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DFFAO00273 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DFFAO00273 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DFFAO00273 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DFFAO00273 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DFFAO00273 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DFFAO00273 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DFFAO00273 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DFFAO00273 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DFFAO00273 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DFFAO00273 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DFFAO00273 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DFFAO00273 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DFFAO00273 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DFFAO00273 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DFFAO00273 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms