Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARVCFO00192 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARVCFO00192 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARVCFO00192 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms