Protein–RNA interactions for Protein: O00159

MYO1C, Unconventional myosin-Ic, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1CO00159 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYO1CO00159 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO1CO00159 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms