Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QRE1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QRE1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QRE1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QRE1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QRE1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QRE1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRE1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRE1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRE1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRE1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRE1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRE1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRE1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms