Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCER2I3L3R5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCER2I3L3R5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCER2I3L3R5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms