Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
I3L3M4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
I3L3M4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
I3L3M4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
I3L3M4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
I3L3M4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
I3L3M4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
I3L3M4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
I3L3M4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
I3L3M4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
I3L3M4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
I3L3M4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
I3L3M4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
I3L3M4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
I3L3M4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
I3L3M4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms