Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H7C1W4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
H7C1W4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1W4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
H7C1W4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1W4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1W4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1W4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1W4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1W4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1W4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1W4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1W4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1W4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1W4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1W4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1W4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1W4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1W4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1W4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1W4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1W4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1W4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1W4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1W4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H7C1W4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
H7C1W4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
H7C1W4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H7C1W4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
H7C1W4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
H7C1W4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H7C1W4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
H7C1W4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
H7C1W4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
H7C1W4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H7C1W4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H7C1W4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
H7C1W4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
H7C1W4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1W4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1W4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1W4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1W4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1W4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1W4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1W4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1W4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1W4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1W4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1W4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1W4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1W4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1W4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1W4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1W4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1W4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1W4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1W4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1W4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1W4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1W4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1W4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1W4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1W4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1W4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1W4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1W4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
H7C1W4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
H7C1W4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
H7C1W4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms