Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H7C1H1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H7C1H1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H7C1H1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H7C1H1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H7C1H1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H7C1H1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H7C1H1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H7C1H1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H7C1H1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H7C1H1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H7C1H1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H7C1H1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H7C1H1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H7C1H1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H7C1H1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H7C1H1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C1H1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C1H1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C1H1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C1H1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C1H1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms