Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0C1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0C1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0C1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0C1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0C1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0C1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0C1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0C1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0C1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0C1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0C1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0C1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0C1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0C1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0C1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H7C0C1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
H7C0C1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0C1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0C1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0C1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0C1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0C1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0C1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0C1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0C1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0C1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0C1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0C1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0C1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0C1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0C1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C0C1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C0C1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C0C1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C0C1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C0C1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C0C1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0C1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0C1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0C1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0C1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms