Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BM21 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BM21 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BM21 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BM21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BM21 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BM21 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BM21 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BM21 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BM21 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BM21 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BM21 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BM21 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BM21 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BM21 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BM21 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BM21 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BM21 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BM21 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BM21 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BM21 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BM21 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BM21 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BM21 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BM21 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BM21 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BM21 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BM21 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BM21 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BM21 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BM21 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BM21 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BM21 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BM21 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BM21 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BM21 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms