Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E5RI56 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E5RI56 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E5RI56 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E5RI56 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E5RI56 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E5RI56 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E5RI56 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E5RI56 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E5RI56 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E5RI56 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E5RI56 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E5RI56 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E5RI56 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E5RI56 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E5RI56 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E5RI56 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E5RI56 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E5RI56 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E5RI56 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E5RI56 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E5RI56 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E5RI56 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E5RI56 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E5RI56 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E5RI56 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E5RI56 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E5RI56 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E5RI56 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E5RI56 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E5RI56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E5RI56 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E5RI56 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E5RI56 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E5RI56 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E5RI56 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E5RI56 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E5RI56 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E5RI56 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E5RI56 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E5RI56 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E5RI56 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E5RI56 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms