Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HHLA1C9JL84 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms