Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9J4A7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9J4A7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9J4A7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9J4A7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9J4A7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9J4A7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9J4A7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9J4A7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9J4A7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9J4A7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9J4A7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9J4A7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9J4A7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9J4A7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9J4A7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9J4A7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9J4A7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9J4A7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9J4A7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9J4A7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
C9J4A7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9J4A7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9J4A7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9J4A7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9J4A7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9J4A7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9J4A7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9J4A7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9J4A7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9J4A7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9J4A7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9J4A7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9J4A7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9J4A7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9J4A7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9J4A7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9J4A7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9J4A7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9J4A7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C9J4A7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9J4A7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9J4A7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9J4A7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9J4A7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9J4A7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9J4A7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms