Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM49D1C9J1S8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM49D1C9J1S8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms