Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms