Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NL46 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NL46 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NL46 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NL46 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NL46 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NL46 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NL46 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NL46 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NL46 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NL46 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NL46 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NL46 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NL46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NL46 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NL46 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NL46 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NL46 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NL46 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NL46 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NL46 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NL46 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NL46 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NL46 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NL46 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NL46 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NL46 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NL46 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NL46 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NL46 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A6NL46 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A6NL46 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A6NL46 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A6NL46 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A6NL46 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A6NL46 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A6NL46 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A6NL46 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A6NL46 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A6NL46 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A6NL46 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A6NL46 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A6NL46 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A6NL46 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A6NL46 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms