Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD3A6NKT7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms