Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms