Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF25A6NGN4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms