Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGPEP1LA6NFU8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms