Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP73A6NFT4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms