Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf60A6NFR6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms