Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6L4A6NEF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms