Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XIRP2A4UGR9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms