Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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